Смотря какой мессенджер.
- отловить появление нового окна - реально
- можно ли из этого окна копипастить - скорее да, не видел еще мессенджеров, кто не дает копировать
но я бы не стал так делать, а поискал в самом мессенджере настройку типа "сохранять историю сообщений в файл", а потом из этого текстового файла парсил номера заказов.