А чем Windows не устраивает? Или вы любите сложности? IMHO с появлением Linux'а, вся концепция Unix стала проваливаться в глубокую ж***. И тем более не понятно, зачем ставить Linux на рабочие станции? Это извращение, IMHO.
По поводу Wine и иже с ним. Если вы используете Linux, то пользуйтесь программами, написанными специально под это дело. Благо их сейчас везде полно. Вы часто видели, чтобы люди на Mac OS пользовались эмуляторами Windows, или на Windows - Linux? И естественно AutoIt в Wine будет работать коряво, не предназначен он для этого.
P.S
У меня на работе стоят пару древних компьютеров, работающих на Aix. Но это серверные машины... Вот где Unix себя оправдывает, я от силы раз в год к ним подхожу. Вообщем каждая ОС хороша на своем месте.
P.S.2
А еще была в свое время такая Be OS...